第一，《世祖实录》记载。顺治十八年（1661年）正月初一日，顺治帝没有视朝，初二日“上不豫”，初四日“上大渐”，初七日“上崩于养心殿”。
第二，曾为顺治帝撰拟董鄂妃祭文的官员张宸记载：“传谕民间勿炒豆，勿燃灯，勿泼水，始知上疾为出痘……十四日，焚大行御冠袍、器用、珍玩于宫门外。时百官哭临未散，遥闻宫中哭声，沸天而出，仰见皇太后黑素袍，御乾清门台基上，南面，扶石而立，哭极哀。”
第三，两位高僧记载。《玉林国师年谱》记载：“……初四，李近侍言：‘圣躬不安之甚。’初七亥刻，驾崩。初八日，皇太后慈旨，请师率众即刻入宫，大行皇帝前说法……二月初二，奉旨到景山，为世祖安位。”玉林和尚亲临顺治帝的大殡。按照他的遗愿，顺治帝死后被火化，由溪森和尚主持。溪森和尚亲自为顺治帝遗体秉炬火化。
第四，顺治帝病危时，翰林院掌院学士王熙起草《遗诏》。《王熙自定年谱》记载：顺治十八年（1661年）正月初二日，顺治帝前往悯忠寺（今法源寺）观看代他出家的替身吴良辅祝法为僧，回来后“圣躬少安”，就是顺治帝突然病倒，病情严重。第二天，顺治帝召王熙到养心殿，赐坐，赐茶。第三天，召入养心殿，“圣躬不安之甚”。初六日子夜，又召王熙到养心殿，说：“朕患痘，势将不起。尔可详听朕言，速撰诏书。”根据顺治帝的意思，撰写《遗诏》，写完一条，立即呈送。一天一夜，三次进览，三蒙钦定。《遗诏》到初七日傍晚撰写修改完毕。当夜，顺治帝就去世了。
第五，西洋人的记载。《汤若望传》记载：“顺治对于痘症有一种极大的恐惧……或许是因他对于这种病症的恐惧，而竟使他真正传染上了这种病症。在这个消息传出宫外之后，汤若望立即亲赴宫中，流着眼泪，请求容许他觐见万岁……顺治病倒三日之后，于一六六一年二月五日到六日之夜间崩驾，享寿还未满二十三岁。”
第六，还有一条旁证。顺治帝死后，在考虑继位者时，孝庄太后最终选定了玄烨，理由之一是玄烨已经出过天花。可见顺治帝因患天花而英年早逝，深深震动了他的母后以至朝廷。综上官方记载与私人记述，顺治帝不是出家，而是病死了。